据《信息时报》报道，新片中，史莱克突然面临继承遥远王国的重任，向来过惯逍遥日子的他视之为烫手山芋，情愿远渡重洋寻找王位又一接班人亚瑟王子。另一方面，被击败的白马王子心有不甘，煽动各童话故事中的反派人物作乱，加上三个调皮捣蛋的小史莱克，怪物先生这回超级麻烦。

麻烦一：要当国王，杀了我吧！

　　完婚后的史莱克和费奥娜公主，来到了遥远王国，并终于安顿下来，开始了皇宫里的新生活。可是变回青蛙的国王，也就是费奥娜的父亲，经过了N次“回光返照”后终于撒手西去，国王这一重任“咣当”一声砸在了史莱克头上。从沼泽地出来的史莱克顿时抓狂，在乡下地方野惯了的他怎么可能忍受得了宫廷拘束的生活？就连娇妻费奥娜公主，也分外挂念沼泽地里的泥巴澡和自由广阔的生活。史莱克不想成为一国之君，可是没有子嗣的老国王去世后，遥远王国必须由一位新主人来统治。这样的麻烦如何解决？

麻烦二：初为人父，一个头两个大！

　　除了要找到遥远王国的继承人，史莱克还有一个更大的烦恼。在这一集，他和新婚的费奥娜已升格为父母，而且，孩子一生就是三个，三个孩子完全遗传了父亲的尊容和习性。在预告片中，我们就可以见到，两个史莱克宝宝玩轮流打嗝，另一个则放屁，场面非常搞笑，在大扭爸爸史莱克的耳朵之余，还一起玩泥浆，弄得全身是泥。宝宝虽然可爱，但史莱克本来也是个贪图安逸，不爱负责任的人。现在突然要承担起当父亲的责任，史莱克当然是一个头，两个大，多了不少成人的烦恼。据了解，《怪物史莱克3》制作期间，全靠梦工厂动画师们积极“造人”，在28人的努力下这些可爱宝宝才得以诞生，难怪片中对于史莱克当爸爸的心情描述颇深，这也为接下来的第四部电影走亲子路线埋下了伏笔。

麻烦三：白马王子变恐怖分子

　　第二集中，一心想娶费奥娜的白马王子，这一集也没有闲着。白马王子如今已经改行为专职戏剧演员，每日在百老汇上演《白马王子大战绿怪兽》的戏剧，掌声没获得多少，番茄鸡蛋得到很多。郁郁不得志的白马王子，并没有空叹“既生瑜，何生亮”，而是决定联合众童话中的众多反角，包括铁钩船长、白雪公主的后母、会说话的大树等，一起向遥远王国发动恐怖袭击行动，挫挫史莱克的锐气，夺回属于他们的“幸福生活”，并彻底改变白马王子引以为耻的历史。于是，在史莱克一行三人不在的情况下，那些传说中的恶棍在白马王子的带领下，一下子占领了宫殿，史莱克后方告急！